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We tested whether a single PCR survey of eDNA in seawater using a broad metazoan primer could identify differences in community composition between five adjacent habitats at 19 sites across a tropical Caribbean bay in Panama. We paired this effort with visual fish surveys to compare methods for a conspicuous taxonomic group. eDNA revealed a tremendous diversity of animals (8,586 operational taxonomic units), including many small taxa that would be undetected in traditional <i>in situ</i> surveys. Fish comprised only 0.07% of the taxa detected by a broad COI primer, yet included 43 species not observed in the visual survey. eDNA revealed significant differences in fish and invertebrate community composition across adjacent habitats and areas of the bay driven in part by taxa known to be habitat-specialists or tolerant to wave action. Our results demonstrate the ability of broad eDNA surveys to identify biodiversity patterns in the ocean.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>////////////////////<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:14.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Detectives del Smithsonian distinguen hábitats marinos tropicales en Panamá utilizando eADN<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><b><span style='font-size:18.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>¿Todos los peces en el mar?<o:p></o:p></span></b></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:14.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Mayo 25, 2020 <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:14.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>https://stri.si.edu/es/noticia/todos-los-peces-en-el-mar<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Una de las grandes interrogantes sobre el uso del ADN en el agua de mar para hacer listas de especies es si proviene de un sitio específico o si ha flotado desde otro lugar. En este estudio, los investigadores pudieron distinguir diferentes hábitats marinos utilizando solo ADN.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Investigadores de seis universidades y museos se reunieron en el Instituto Smithsonian de Investigaciones Tropicales (STRI) y descubrieron ADN de casi 9000 distintos tipos de animales en las aguas de la Bahía de Almirante y sus alrededores en la provincia de Bocas del Toro de Panamá. Apostaron por una técnica poderosa no solo para identificar especies en peligro de extinción e invasoras, sino también para monitorear los cambios ambientales en la Bahía. El equipo demostró que podían distinguir la diferencia entre cinco hábitats diferentes basados en minúsculos trozos de ADN que flotaban en el agua de mar. ¡No solo detectaron muchos de los peces en el mar, sino que también detectaron miles de invertebrados marinos, microbios e incluso un ratón!<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>"Por lo general, los estudios marinos se centran en un grupo: peces, invertebrados o microbios", comentó Matthieu Leray, becario postdoctoral en STRI, que lidera un proyecto más amplio para comparar organismos marinos en los océanos Caribe y Pacífico de Panamá. "En esta investigación tratamos de observar todos los grupos de animales simultáneamente. Una razón por la que podríamos hacer eso es porque la fauna marina de Bocas del Toro es relativamente conocida".<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Compararon cinco hábitats diferentes (manglares, lechos de pastos marinos, fondos arenosos, arrecifes de coral y muelles de botes) de la manera tradicional (un buzo nada y registra todos los peces que ve) y también recolectando ADN ambiental (eADN) en muestras de agua de cada hábitat.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Elaine Shen, ex pasante de licenciatura de la Universidad de Rice, escribió el artículo resultante en Informes científicos basados en su proyecto de investigación de pasantías de verano.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>"Espero que esto inspire a otros estudiantes universitarios a solicitar fondos para investigación y pasantías remuneradas que parecen estar fuera de su alcance, pero que en realidad son alcanzables. Me hizo creer que, si estás dispuesto a trabajar, todo es posible". Elaine, ahora estudiante de doctorado en la Universidad de Rhode Island, espera pacientemente a que termine la cuarentena para partir a Indonesia a trabajar en su investigación doctoral utilizando las mismas técnicas de ADN en un área donde se sabe mucho menos.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><a href="https://stri.si.edu/sites/default/files/styles/lightbox/public/fish_in_the_sea_photo_2.jpg?itok=7a7JDHxn" title=""Smithsonian Tropical Research Institute" "><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman","serif";color:blue;mso-fareast-language:ES;text-decoration:none'><img border=0 width=879 height=662 id="Imagen_x0020_2" src="cid:image001.jpg@01D63686.B3F95DB0" alt="Smithsonian Tropical Research Institute"></span></a><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman","serif";mso-fareast-language:ES'><o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman","serif";mso-fareast-language:ES'>Figura que resume los principales resultados del artículo (Elaine Shen). *Texto en la imagen: La investigación ambiental de ADN captura patrones de peces y la diversidad de invertebrados en el paisaje marino tropical Usando eDNA descubrimos que las comunidades animales no se distinguían entre los hábitats adyacentes y descubrimos más diversidad de peces que las observaciones concurrentes.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>El ADN en el agua de mar proviene de lo que los animales dejan: excremento, piel y células sanguíneas, escamas y moco.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Los genetistas determinan y comparan la secuencia de nucleótidos en cada cadena de ADN. Imagine un collar de perlas de diferentes colores. Cada secuencia única (patrón de colores) se denomina unidad taxonómica operativa (OTU). Al comparar estos patrones con las secuencias de ADN de las especies recolectadas anteriormente, descubren qué especies estaban en cada muestra de agua. Debido a que el Smithsonian tiene una estación marina en Bocas del Toro, aprovecharon una enorme base de datos de 6,500 especies que los científicos han registrado durante las últimas dos décadas, así como varias otras herramientas como una guía virtual de <a href="https://biogeodb.stri.si.edu/caribbean/es/pages"><span style='color:blue'>Peces del Gran Caribe,</span></a> disponible como aplicación para iPhone.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>En total, encontraron 23,123 OTU diferentes. 8,781 de estos eran animales multicelulares. Y de estos, pudieron identificar alrededor de 800 especies. Los peces representaron menos del uno por ciento del total, según los resultados de eADN. De todos los OTU que podrían coincidir con especies conocidas, solo se informó previamente del 40 por ciento. Eso significa que cientos de nuevas especies esperan ser descubiertas.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Aunque los buzos que realizaron el estudio visual tradicional observaron un total estimado de 7 millones de peces, el número total de especies en sus listas fue de solo 97. La técnica de eADN, que requiere menos mano de obra, encontró 43 especies adicionales.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>Al comparar el ADN del agua de mar, pudieron distinguir entre manglares y sitios de pastos marinos, entre arrecifes y sitios arenosos y entre sitios que estaban en la bahía y sitios expuestos a condiciones de océano abierto. Los manglares fueron los más diversos, seguidos de los lechos de pastos marinos, aguas abiertas (muestras de muelles), fondos arenosos y arrecifes de coral. Aunque los arrecifes pueden albergar a los animales más llamativos... peces de colores brillantes y anémonas de mar, estos otros hábitats albergan animales discretos que aún no se han identificado.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>"Nuestro hallazgo de que el eADN recolectado de distintos hábitats fue diferente es importante", comentó Leray. "No existe una herramienta mágica para estudiar la biodiversidad marina. A las personas les ha preocupado que el ADN en el agua de mar pueda moverse y no representar un hábitat en particular. El ADN dura de 8 horas a un día, por lo que puede moverse en cierta medida, pero demostramos que era específico de un hábitat dado".<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:ES'>"Eso fue realmente lo mejor de nuestro proyecto", comentó Bryan Nguyen, miembro del Museo Nacional de Historia Natural en Washington. "Debido a que podríamos mostrar diferencias entre hábitats, descubrimos algo nuevo sobre eADN que será útil en el futuro a medida que monitoreamos diversos paisajes marinos. También nos enseñó el valor del uso de eADN y métodos visuales. Cada técnica le brinda diferentes partes de la imagen. Con ambos, obtienes una vista mucho más completa".<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p></div><div id="DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2"><br /> <table style="border-top: 1px solid #D3D4DE;">
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<td style="width: 55px; padding-top: 18px;"><a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=emailclient" target="_blank"><img src="https://ipmcdn.avast.com/images/icons/icon-envelope-tick-round-orange-animated-no-repeat-v1.gif" alt="" width="46" height="29" style="width: 46px; height: 29px;" /></a></td>
<td style="width: 470px; padding-top: 17px; color: #41424e; font-size: 13px; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; line-height: 18px;">Libre de virus. <a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=emailclient" target="_blank" style="color: #4453ea;">www.avast.com</a> </td>
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